Поддержка пользователей

h1. Использование компилятора Portland

Для использования компилятора pgi требуется включить модуль окружения pgi64

<pre>

$ module load pgi64

</pre>После этого становятся доступными @pgcc@ (драйвер компилятора C), @pgCC@ (драйвер компилятора C++), @pgfortran@ (@pgf95@, @pgf90@ и @pgf77@ включают опции, специфические для соответствующих диалектов). 

При запуске программ скомпилированных ими лучше тоже подключать модуль pgi64.

h2. PGI + MPI

В настоящее время на кластере поддерживаются две библиотеки MPI: OpenMPI и MPICH (идущая в комплекте с PGI). Рекомендуется использовать OpenMPI, т.к. в MPICH отсутствует поддержка Infiniband. 

Последовательность действий для компиляции и запуска MPI программы следующая:

* Загрузить модуль окружения для выбранной библиотеки MPI и компилятора. При использовании PGI модуль pgi64 будет загружен автоматически.

<pre>$ module load openmpi/pgi # или mpich/pgi, или openmpi/gcc</pre>

Если подключить сразу два модуля, то ничего хорошего скорее всего не выйдет. Проверить список подключенных модулей можно командой @module list@, а отключить все подключенные модули командой @module purge@.

* Скомпилировать программу с помощью обертки для компилятора @mpicc@, @mpif77@ или @mpif90@. При этом будет вызван выбранный компилятор. Оберткам можно передавать все специфичные для выбранного компилятора опции.

<pre>$ mpicc mysource.c -o myprogram</pre>

Если сборка производится с помощью @make@, то возможно потребуется явно указать на использование обертки компилятора (mpicc, mpif77, ...) с помощью переменных @CC, FC, F77, F90, CXX@ и т.п. 

</pre>

* В скрипт для запуска задачи через систему очередей добавить загрузку модуля окружения (@module load <выбранный модуль>@). Поставить задачу в очередь. [[manual_queue|Подробнее про систему очередей]]

<pre>

$ qsub -l nodes=4 mystartscript.sh

</pre>